Przejdź do treści
Technologie

Analiza danych medycznych i biomedycznych w Python

Kompleksowe szkolenie z analizy danych medycznych i biomedycznych w Python. Uczestnicy poznają biblioteki pandas i scipy do analizy danych klinicznych, BioPython do bioinformatyki, narzędzia do obrazowania medycznego (SimpleITK, pydicom), przetwarzanie danych z elektronicznej dokumentacji medycznej (EHR) oraz wymogi zgodności z FDA i HIPAA.

Dlaczego warto wybrać to szkolenie?

Python stał się jednym z najważniejszych narzędzi w analizie danych biomedycznych, oferując bogaty ekosystem bibliotek do przetwarzania danych klinicznych, bioinformatyki i obrazowania medycznego. Rosnące wymagania regulacyjne w sektorze farmaceutycznym i medycznym sprawiają, że specjaliści muszą łączyć zaawansowane umiejętności programistyczne z wiedzą o zgodności z FDA i HIPAA.

Podczas szkolenia uczestnicy poznają praktyczne zastosowania pandas i scipy w analizie danych klinicznych, BioPython w bioinformatyce, a także narzędzia SimpleITK i pydicom do przetwarzania obrazów medycznych — z naciskiem na przetwarzanie danych EHR i zgodność regulacyjną.

Po ukończeniu szkolenia uczestnicy będą potrafili: analizować dane z badań klinicznych z wykorzystaniem pandas i scipy, stosować BioPython do analizy sekwencji biologicznych i danych genomowych, przetwarzać obrazy medyczne w formacie DICOM z użyciem SimpleITK i pydicom, budować pipeline’y do przetwarzania danych z elektronicznej dokumentacji medycznej. Te kompetencje bezpośrednio przekładają się na wyższą efektywność w realizacji projektów IT.

Szkolenie jest szczególnie wartościowe dla: analityków danych pracujących w sektorze medycznym i farmaceutycznym, bioinformatyków i biostatystyków, badaczy klinicznych wykorzystujących Python w analizie danych.

Co wyróżnia nasze podejście?

W EITT wierzymy, że najlepsza nauka odbywa się przez praktykę. W ciągu 3 dni intensywnego szkolenia uczestnicy pracują na realnych przykładach i scenariuszach, co gwarantuje nie tylko zrozumienie teorii, ale przede wszystkim umiejętność jej praktycznego zastosowania.

Z ponad 2500 szkoleń w ofercie i oceną 4.8/5 od uczestników, EITT jest zaufanym partnerem w rozwoju kompetencji dla organizacji każdej wielkości. Nasi trenerzy to praktycy z wieloletnim doświadczeniem, którzy dzielą się aktualną wiedzą i sprawdzonymi rozwiązaniami.

Szukasz szkolenia dopasowanego do potrzeb Twojego zespołu? Skontaktuj się z nami — przygotujemy program dostosowany do Twoich wymagań.

Korzyści

  • Analizować dane z badań klinicznych z wykorzystaniem pandas i scipy
  • Stosować BioPython do analizy sekwencji biologicznych i danych genomowych
  • Przetwarzać obrazy medyczne w formacie DICOM z użyciem SimpleITK i pydicom
  • Budować pipeline'y do przetwarzania danych z elektronicznej dokumentacji medycznej
  • Wykonywać analizę przeżycia z biblioteką lifelines
  • Stosować metody NLP do przetwarzania tekstu medycznego
  • Tworzyć reprodukowalne raporty analityczne w Jupyter Notebook
  • Zapewnić zgodność analiz z wymogami FDA i HIPAA

Dla kogo jest to szkolenie?

Analitycy danych pracujący w sektorze medycznym i farmaceutycznym
Bioinformatycy i biostatystycy
Badacze kliniczni wykorzystujący Python w analizie danych
Specjaliści ds. danych w firmach farmaceutycznych i CRO
Programiści Python zainteresowani zastosowaniami biomedycznymi
Inżynierowie danych w organizacjach ochrony zdrowia
Osoby odpowiedzialne za przetwarzanie obrazów medycznych

Wymagania wstępne

  • Podstawowa znajomość Python (zmienne, funkcje, struktury danych, pętle)
  • Znajomość podstaw biblioteki pandas
  • Podstawowa wiedza z zakresu statystyki opisowej
  • Własny laptop z zainstalowanym Python 3.9+ i Jupyter Notebook

Program szkolenia

01

Wprowadzenie do analizy danych biomedycznych w Python

  • Ekosystem Python dla nauk biomedycznych
  • Konfiguracja środowiska: Jupyter, conda, virtualenv
  • Przegląd kluczowych bibliotek: pandas, numpy, scipy, scikit-learn
  • Standardy danych medycznych (HL7, FHIR, CDISC)
  • Wymogi regulacyjne FDA i HIPAA w analizie danych
02

Analiza danych klinicznych z pandas i scipy

  • Wczytywanie i czyszczenie danych klinicznych z pandas
  • Statystyczna analiza wyników badań klinicznych
  • Analiza przeżycia z biblioteką lifelines
  • Wizualizacja danych medycznych z matplotlib i seaborn
  • Obsługa brakujących danych i imputacja w kontekście medycznym
03

Bioinformatyka z BioPython

  • Wprowadzenie do BioPython — sekwencje, struktury, bazy danych
  • Analiza sekwencji DNA, RNA i białek
  • Przeszukiwanie baz danych biologicznych (NCBI, UniProt)
  • Wyrównywanie sekwencji i analiza filogenetyczna
  • Przetwarzanie danych z eksperymentów NGS
04

Obrazowanie medyczne — SimpleITK i pydicom

  • Wczytywanie obrazów DICOM z pydicom
  • Przetwarzanie i filtracja obrazów z SimpleITK
  • Segmentacja struktur anatomicznych
  • Ekstrakcja cech radiomicznych
  • Integracja danych obrazowych z danymi klinicznymi
05

Przetwarzanie EHR, walidacja i zgodność regulacyjna

  • Praca z danymi z elektronicznej dokumentacji medycznej
  • Przetwarzanie tekstu medycznego z NLP (spaCy, scispaCy)
  • Anonimizacja i deidentyfikacja danych pacjentów
  • Tworzenie reprodukowalnych pipeline'ów analitycznych
  • Dokumentacja i raportowanie zgodne z wymogami FDA

Formy realizacji

Online

  • Wygoda uczestnictwa z dowolnego miejsca
  • Interaktywne sesje na żywo z trenerem
  • Materiały dostępne przez 30 dni
  • Brak kosztów dojazdu

Stacjonarnie

  • Bezpośredni kontakt z trenerem i grupą
  • Intensywne warsztaty praktyczne
  • Networking z innymi uczestnikami
  • Pełne skupienie na nauce

Najczęściej zadawane pytania

Jakie wymagania wstępne muszę spełnić przed szkoleniem?

Wymagana jest podstawowa znajomość Python (zmienne, funkcje, struktury danych, pętle) oraz biblioteki pandas. Zalecana jest podstawowa wiedza ze statystyki opisowej. Znajomość biologii lub medycyny nie jest wymagana — kluczowe pojęcia zostaną wyjaśnione podczas szkolenia.

W jakim formacie odbywa się szkolenie i ile trwa?

Szkolenie trwa 3 dni i jest dostępne w formacie online (na żywo) oraz stacjonarnym. Program łączy wykłady z intensywnymi ćwiczeniami praktycznymi na rzeczywistych zbiorach danych medycznych. Uczestnicy otrzymują materiały szkoleniowe, gotowe notebooki Jupyter oraz certyfikat ukończenia.

Dla kogo przeznaczone jest to szkolenie?

Szkolenie skierowane jest do analityków danych z sektora medycznego i farmaceutycznego, bioinformatyków, badaczy klinicznych oraz specjalistów ds. danych w firmach farmaceutycznych i CRO. Sprawdzi się również dla programistów Python chcących rozwinąć kompetencje w zastosowaniach biomedycznych oraz inżynierów danych w organizacjach ochrony zdrowia.

Anna Polak
Anna Polak Opiekun szkolenia

Poproś o ofertę

Możliwości dofinansowania

Sprawdź możliwości dofinansowania dla Twojej firmy

Zaufali nam

Szkolimy zespoły największych polskich firm

ING Bank - klient EITT
mBank - klient EITT
PKO Bank Polski - klient EITT
PZU - klient EITT
Allianz - klient EITT
T-Mobile - klient EITT
KGHM - klient EITT
PGE - klient EITT
IKEA - klient EITT
InPost - klient EITT
Leroy Merlin - klient EITT
ZUS - klient EITT

Zainteresowany tym szkoleniem?

Skontaktuj się z nami - przygotujemy ofertę dopasowaną do potrzeb Twojego zespołu.

500+ ekspertów
2500+ szkoleń w ofercie
ISO 9001 certyfikat jakości
Zapytaj o szkolenie
Zadzwoń do nas +48 22 487 84 90